Орешкова Н.В.   Белоконь М.М.  

Генетическая дифференциация популяции лиственницы сибирской (Larix sibirica Ledeb.) по микросателлитным локусам

Reporter: Орешкова Н.В.

В настоящее время для анализа внутри- и межвидовой генетической дифференциации хвойных активно начали использовать наиболее информативную и сравнительно недорогую группу ДНК-маркеров, к которым относятся микросателлиты. Микросателлиты очень короткие (2-6 нуклеотидов), среднеповторяющиеся, тандемно организованные, высоковариабельные последовательности ДНК (Глазко, Глазко, 2001). Высокий уровень полиморфизма микросателлитов, относительно равномерное их распределение в геноме и широкая представленность сделала их чрезвычайно популярными и широко используемыми в современных популяционно-генетических исследованиях.
Целью нашей работы явилось получение качественно новой информации при оценке генетической изменчивости и анализа генетической дифференциации лиственницы сибирской с использованием метода микросателлитного анализа.
В качестве объектов исследования взяты выборки из семи природных популяций лиственницы сибирской, произрастающей в различных районах ее естественного распространения на территории Красноярского края (п-ов Таймыр), Республик Тыва и Алтай. Для выделения ДНК использовали хвою. Выделения проводили по стандартному протоколу для растительных тканей с применением цетилтриметиламмониумбромида (CTAB) (Devey et al., 1996).
В результате тестирования 25 праймеров для последующего анализа были отобраны 10 микросателлитных локусов. Характеристики микросателлитных локусов и условия ПЦР-амплификации приведены в таблице.
По результатам работы были получены данные о генетическом разнообразии исследованных популяций лиственницы сибирской, проведен анализ уровня генетической дифференциации популяции с помощью показателей F-статистик Райта (Wright, 1965) и генетического расстояния D по М. Неи (Nei, 1972). Статистическую обработку полученных данных осуществляли в программе GenAlEx 6.2 (Peakall, Smouse, 2006).

Работа выполнена при частичной финансовой поддержке Интеграционного проекта СО РАН № 76, РФФИ (№ 10-04-00786-а; № 10-04-90819-моб_ст.; № 11-04-00478-а; №11-04-92112-ЯФ_а).
 

Abstracts file: Орешкова.doc


To reports list